RNA-Seq转录组数据分析解决方案定制开发
服务简介
我们专注于高通量RNA测序(RNA-Seq)转录组数据分析解决方案的定制开发,致力于为科研机构、生物技术企业和医药研发单位提供高效、精准、可扩展的生物信息学服务。我们的分析流程基于当前主流的生物信息学工具和严格的科学标准,涵盖从原始数据质量控制到下游功能注释和可视化展示的全流程分析,全面支持mRNA、lncRNA、circRNA、miRNA等不同类型转录本的研究需求。
本服务不仅限于标准流程,还可根据客户项目特点进行深入定制,包括但不限于特定物种参考基因组支持、批量样本自动化分析流程开发、云端分析环境部署、高可重现性pipeline构建等。我们熟悉多种测序平台生成的数据格式(如Illumina FASTQ、BGISEQ、Nanopore长读长等),具备丰富的跨平台数据处理经验,能快速适配不同实验方案。
我们提供的RNA-Seq分析服务模块包括但不限于:
- 原始数据质控(FastQC、多样本整合报告)
- Reads过滤与修剪(Trimmomatic/Cutadapt)
- 比对到参考基因组(STAR/HISAT2)
- 转录本组装与基因定量(StringTie/featureCounts)
- 差异表达分析(DESeq2、edgeR、limma等)
- 功能富集分析(GO、KEGG、Reactome、DO等)
- 高质量可视化图表输出(PCA、聚类热图、火山图、表达谱等)
- 非模型物种或de novo转录组组装支持(Trinity等)
- 分析结果解释与论文图表支持(可辅助发表)
凭借多年生物信息领域的经验,我们能够将复杂的转录组数据转化为直观、可解释的科研成果或产品研发支撑材料,帮助客户快速推进课题研究或产品开发。
分析流程
我们的分析流程遵循科学规范,确保数据处理的每一步都高效、可靠。主要流程包括:
- 数据质量控制:使用FastQC进行质量检查,识别并剔除低质量的reads。
- 数据清理与修剪:Trimmomatic和Cutadapt用于修剪接头和低质量序列。
- 基因组比对:采用STAR或HISAT2进行高效准确的比对。
- 转录本组装与定量:使用StringTie和featureCounts进行基因表达定量分析。
- 差异表达分析:采用DESeq2、edgeR等工具对不同条件下的基因表达进行差异分析。
- 功能富集分析:通过GO、KEGG等数据库进行基因功能与通路分析。
- 数据可视化:生成PCA图、热图、火山图等多种可视化图表,帮助科研人员直观展示结果。
我们的优势
- 深耕生物信息学领域多年,积累了丰富的RNA-Seq数据分析经验。
- 支持多平台数据格式,快速适配不同实验设计需求。
- 提供高效的自动化pipeline,支持本地部署与云端部署。
- 灵活的定制开发,满足不同客户的个性化需求。
- 交付的分析结果具有高度可靠性,支持科研论文和项目报告使用。
常见问题
- Q: 你们支持哪些测序平台的RNA-Seq数据?
- A: 支持Illumina、BGI、PacBio、Nanopore等主流平台。
- Q: 能否根据课题定制特定分析?
- A: 可以。我们根据每个项目的研究目标灵活调整分析流程。
- Q: 数据是否安全?
- A: 我们严格遵守数据隐私协议,可签署保密协议(NDA)。
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