多组学数据分析解决方案定制开发
为制药企业、科研机构与医疗数据平台提供从数据预处理、分析建模到可视化与系统集成的一体化生信解决方案,支持基因组、转录组、表观组、蛋白组与代谢组等多组学数据处理与软件平台构建。
核心技术能力
- 数据采集与格式转换:支持FASTQ、BAM、VCF、GTF、mzML、CEL、SRA等常用数据格式解析与标准化转换。
- 高通量测序分析(NGS):基于 GATK、BWA、STAR、HISAT2、Samtools、Picard 等工具完成序列比对、变异检测(SNV/INDEL/CNV)、融合基因分析、转录本重建等任务。
- 差异表达与通路富集分析:使用 DESeq2、edgeR、limma、ClusterProfiler、GSEA 实现精确的统计分析与 KEGG/GO 富集注释。
- 表观遗传学分析:ChIP-Seq、ATAC-Seq 数据处理与peak calling(MACS2)、motif 分析、染色质可及性建模。
- 蛋白组学与代谢组学数据处理:MaxQuant、Perseus、MetaboAnalyst、MS-DIAL 等工具支持定量、定性分析,提供代谢通路注释。
- 多组学整合分析:支持 iCluster、MOFA、DIABLO、mixOmics 等多组学数据融合框架,帮助构建系统生物学模型。
- AI+生信建模:使用 XGBoost、Random Forest、SVM、深度学习框架(如 TensorFlow/PyTorch)进行生物标志物识别、特征选择与疾病预测。
- 交互式可视化开发:基于 Plotly、Shiny、Dash、Highcharts 和 D3.js 实现交互式分析报告与动态仪表盘。
- 本地部署与私有云服务:支持在 HPC、Linux 集群、私有云(OpenStack/K8s)上部署完整平台,保障数据合规性(GDPR、HIPAA)。
定制化生物信息分析平台开发
我们不仅提供分析服务,还开发完整的分析系统和平台,满足企业对长期数据处理的自动化、可扩展性和用户友好性的要求:
- 全流程自动化 Pipeline 开发(使用 Snakemake / Nextflow / CWL)
- 基于 Docker + Kubernetes 的模块化平台架构设计
- 多用户权限管理系统开发,支持 LDAP/AD 集成
- 集成 Web 可视化界面、任务调度与日志追踪系统
- 分析结果一键导出为 PDF/Excel/HTML 格式报告
- API 网关开发,支持 RESTful 和 GraphQL 接口
- 与 LIMS、ELN、EHR 系统无缝对接
典型客户与应用场景
- 制药公司:药物靶点发现、化合物筛选、多组学数据支持的机制研究平台
- 科研院所与高校实验室:科研项目数据处理、课题发表支持、定制Pipeline部署
- 医疗健康企业:肿瘤、罕见病基因分析、个性化诊疗支持
- 第三方CRO机构:大批量样本分析流程标准化、自动报表系统
- 生物样本库:样本信息结构化管理与基因型-表型关联分析
数据安全与合规保障
我们严格遵循各国数据隐私法规,在生信平台部署与数据处理过程中,确保敏感信息安全性,包括:
- GDPR、HIPAA、ISO 27001 标准兼容的隐私保护方案
- 传输加密、文件加密、用户权限控制与审计日志
- 本地部署与专线传输,避免数据出网
- 长期数据存储与备份策略设计
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